Следственные органы утверждают, что Дзепа совместно с группой лиц незаконно выводил средства из городской казны и оформлял на себя земельные участки и недвижимость. Ущерб оценивается в 200 млн рублей.
По версии следствия, бизнесмен вместе с подельниками в период с декабря 1997 года по август 2010 года заключали контракты с мэрией. Документы оформлялись от имени подконтрольных бизнесмену ООО. Затем предоставлялись фиктивные отчеты, подтверждавшие выполнение работ. А в 2003–2004 годах группа легализовала полученное имущество.