Противоправная деятельность Попова была выявлена правоохранителями в 2017 году. Установлено, что на тот момент гендиректор водоканала организовал хищение 607,5 млн рублей, на которые должны были провести модернизацию станции аэрации.
Попов обеспечил заключение договора с аффилированной компанией, после чего она получила аванс. Впоследствии работы по модернизации выполнены не были, а денежные средства похитили. По данному факту было возбуждено уголовное дело.
Известно, что Попов скрылся от правоохранителей за границей, но в итоге был задержан на территории Черногории. В ноябре прошлого года суд приговорил экс-главу водоканала к семи годам колонии общего режима. Также он должен выплатить штраф в размере 700 тысяч рублей. В июне 2022-го приговор вступил в законную силу.